По национальности лакец[1]. Родовое село Кумух Лакского района. Родился в Баку. Окончил восьмилетку в школе города Харьков. Учился в пгт. Клевань Украинской ССР.
В середине шестидесятых годов семья Манаровых приехала в Алатырь (Чувашская АССР), когда отца назначили командиром местной войсковой части. Учился Муса c 1966 года в средней школе № 8 города Алатырь и десятый класс в 1968 году окончил с золотой медалью.
По окончании школы поступил в Московский авиационный институт, который окончил в 1974 году (факультет радиоэлектроники летательных аппаратов).
То что он родился в Баку не делает его автоматически азербаджанским космонавтом. Каспаров это подвердит.